Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CHIC1Q5VXU3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
CHIC1Q5VXU3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.2 ms