Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ATRNL1Q5VV63 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATRNL1Q5VV63 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATRNL1Q5VV63 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATRNL1Q5VV63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms