Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP9Q5VTM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGAP9Q5VTM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms