Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SYDE2Q5VT97 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYDE2Q5VT97 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYDE2Q5VT97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYDE2Q5VT97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms