Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
STRIP1Q5VSL9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
STRIP1Q5VSL9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms