Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HES3Q5TGS1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HES3Q5TGS1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HES3Q5TGS1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HES3Q5TGS1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms