Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBAP2Q5T6F2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBAP2Q5T6F2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP2Q5T6F2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms