Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HP1BP3Q5SSJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms