Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NUP188Q5SRE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NUP188Q5SRE5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP188Q5SRE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP188Q5SRE5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms