Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHC1Q5JVL4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHC1Q5JVL4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHC1Q5JVL4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms