Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITRM1Q5JRX3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PITRM1Q5JRX3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PITRM1Q5JRX3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms