Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MS4A13Q5J8X5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A13Q5J8X5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MS4A13Q5J8X5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MS4A13Q5J8X5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms