Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRDTQ58F21 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRDTQ58F21 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BRDTQ58F21 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRDTQ58F21 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BRDTQ58F21 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms