Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIN4Q56A73 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPIN4Q56A73 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPIN4Q56A73 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms