Protein–RNA interactions for Protein: Q53FP2

TMEM35A, Transmembrane protein 35A, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35AQ53FP2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM35AQ53FP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM35AQ53FP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35AQ53FP2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms