Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GREB1Q4ZG55 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GREB1Q4ZG55 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GREB1Q4ZG55 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms