Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FBXO43Q4G163 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO43Q4G163 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO43Q4G163 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms