Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC153Q494R4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC153Q494R4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC153Q494R4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms