Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
KRTAP20-2Q3LI61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
KRTAP20-2Q3LI61 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms