Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q3C1V9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q3C1V9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q3C1V9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q3C1V9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3C1V9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3C1V9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3C1V9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3C1V9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q3C1V9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q3C1V9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q3C1V9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q3C1V9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Q3C1V9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q3C1V9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q3C1V9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3C1V9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3C1V9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3C1V9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3C1V9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3C1V9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q3C1V9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3C1V9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3C1V9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3C1V9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3C1V9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Q3C1V9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3C1V9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3C1V9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3C1V9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3C1V9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3C1V9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3C1V9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Q3C1V9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q3C1V9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3C1V9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3C1V9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3C1V9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3C1V9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q3C1V9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3C1V9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3C1V9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3C1V9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q3C1V9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3C1V9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3C1V9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3C1V9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3C1V9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q3C1V9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q3C1V9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3C1V9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3C1V9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Q3C1V9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Q3C1V9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Q3C1V9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3C1V9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3C1V9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3C1V9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3C1V9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3C1V9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3C1V9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q3C1V9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms