Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBC4

PRICKLE4, Prickle-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE4Q2TBC4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRICKLE4Q2TBC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRICKLE4Q2TBC4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRICKLE4Q2TBC4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms