Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTC1Q2NKJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTC1Q2NKJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTC1Q2NKJ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTC1Q2NKJ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTC1Q2NKJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CTC1Q2NKJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTC1Q2NKJ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTC1Q2NKJ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTC1Q2NKJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms