Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRED3Q2MJR0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRED3Q2MJR0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRED3Q2MJR0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms