Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC96Q2M329 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC96Q2M329 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms