Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1AQ16623 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX1AQ16623 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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