Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NREPQ16612 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NREPQ16612 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NREPQ16612 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NREPQ16612 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NREPQ16612 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NREPQ16612 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NREPQ16612 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NREPQ16612 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NREPQ16612 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NREPQ16612 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NREPQ16612 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NREPQ16612 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NREPQ16612 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NREPQ16612 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NREPQ16612 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NREPQ16612 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NREPQ16612 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NREPQ16612 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
NREPQ16612 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NREPQ16612 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NREPQ16612 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NREPQ16612 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NREPQ16612 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NREPQ16612 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NREPQ16612 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NREPQ16612 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NREPQ16612 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NREPQ16612 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms