Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECM1Q16610 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
ECM1Q16610 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECM1Q16610 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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