Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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SGCAQ16586 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SGCAQ16586 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SGCAQ16586 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SGCAQ16586 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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SGCAQ16586 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SGCAQ16586 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SGCAQ16586 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCAQ16586 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SGCAQ16586 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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SGCAQ16586 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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SGCAQ16586 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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SGCAQ16586 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SGCAQ16586 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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