Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRNP35Q16560 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRNP35Q16560 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRNP35Q16560 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms