Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX1Q16384 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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SSX1Q16384 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX1Q16384 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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SSX1Q16384 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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SSX1Q16384 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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SSX1Q16384 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SSX1Q16384 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SSX1Q16384 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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SSX1Q16384 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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SSX1Q16384 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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SSX1Q16384 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SSX1Q16384 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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