Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB11BQ15907 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB11BQ15907 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.2 ms