Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USF2Q15853 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USF2Q15853 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
USF2Q15853 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
USF2Q15853 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
USF2Q15853 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
USF2Q15853 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
USF2Q15853 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
USF2Q15853 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USF2Q15853 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USF2Q15853 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms