Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRK1Q15835 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRK1Q15835 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRK1Q15835 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms