Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIP4Q15650 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP4Q15650 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP4Q15650 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
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