Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBQ15464 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBQ15464 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBQ15464 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SHBQ15464 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SHBQ15464 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHBQ15464 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHBQ15464 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHBQ15464 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHBQ15464 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SHBQ15464 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SHBQ15464 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBQ15464 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBQ15464 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBQ15464 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBQ15464 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBQ15464 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SHBQ15464 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SHBQ15464 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBQ15464 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBQ15464 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBQ15464 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBQ15464 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHBQ15464 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms