Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP1Q15431 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP1Q15431 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYCP1Q15431 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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