Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PUM3Q15397 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PUM3Q15397 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PUM3Q15397 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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