Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC3Q15034 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC3Q15034 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC3Q15034 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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