Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCLAFQ15004 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCLAFQ15004 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCLAFQ15004 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms