Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSPNQ14714 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSPNQ14714 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SSPNQ14714 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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