Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RFTN1Q14699 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFTN1Q14699 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN1Q14699 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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