Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RBM39Q14498 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RBM39Q14498 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RBM39Q14498 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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