Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1CQ14123 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE1CQ14123 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE1CQ14123 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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