Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2H3Q13889 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2H3Q13889 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H3Q13889 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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