Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CACNA1SQ13698 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CACNA1SQ13698 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CACNA1SQ13698 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CACNA1SQ13698 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
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