Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA7Q13683 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA7Q13683 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA7Q13683 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA7Q13683 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA7Q13683 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA7Q13683 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA7Q13683 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA7Q13683 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA7Q13683 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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