Protein–RNA interactions for Protein: Q13621

SLC12A1, Solute carrier family 12 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A1Q13621 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC12A1Q13621 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC12A1Q13621 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC12A1Q13621 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms