Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PEX6Q13608 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PEX6Q13608 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PEX6Q13608 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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