Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRR1Q13601 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRR1Q13601 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRR1Q13601 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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