Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAE1Q13564 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAE1Q13564 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NAE1Q13564 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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